Cell | 免疫疾病中免疫细胞特异基因调控动态特写

北海道大学的研究课题医护人员和RIKEN Research研究课题所的上司们仍未建起了首个针对自身抗体性哮喘和自身坏死性哮喘的遗传学物质元原始数据。努力这一资源能为抗体哮喘的转型包括原先立论，并可能有助于药品的辨认出。研究团队们还努力，与抗体方面的遗传学物质组原始数据图集最终可能引入诸如COVID-19等传染病的研究课题。

北海道大学项目研究课题助理，临床风湿病学家，系统遗传学物质组学专家Mineto Ota博士知道：“要洞察哮喘，就只能深刻理解遗传学物质变异的系统。有了这个原始数据集，我们就可以将与哮喘方面的DNA数列变化的原始数据与对哮喘发病系统更加极其重要的遗传学物质和巨噬细胞一般来知道连系痛快。”Ota是该团队发表在《Cell》杂志上的撰文的主要所作，撰文歌名为“Dynamic landscape of immune cell-specific gene regulation in immune-mediated diseases”。该项目是与Chugai Pharmaceutical的研究团队们合作顺利进行的。

所作写道，抗体内源性的哮喘（IMD）包含从自身抗体性到自身坏死的多种病症。他们得出结论，尽管IMD里面炎性巨噬细胞因子的异常商业活动得出结论抗体巨噬细胞系统发生了变化，但是，“对于IMD的方面遗传学物质甚至方面巨噬细胞一般来知道知之甚少。”

仅有遗传学物质组共同点研究课题（GWAS）辨认出了许多与IMD方面的遗传学物质组基因座。但是，在此类共同点研究课题里面鉴定出的许多遗传学物质变异都位处调节遗传学物质“on”或“off”隐含的DNA非编码地带，而不是位处遗传学物质编码数列里面。研究课题团队得出结论：“GWAS仍未了解到了许多与复杂性状和哮喘方面的遗传学物质组基因座，包含IMD。这些变异里面的大多数都位处非编码遗传学物质组地带，众所周知是内源性元件，如增强子和残基。”

为了了解到内源性DNA的系统，一种相同一般来知道的遗传学物质组数据分析，叫做隐含定量性状遗传学物质基因座（eQTL），旨在将DNA数列的区别与遗传学物质隐含的区别连系痛快。借助eQTL原始数据，研究课题医护人员可以对内源性DNA数列的旨在、内源性数列里面的变异如何影响其内源性遗传学物质的隐含以及这些遗传学物质隐含区别如何引致哮喘毫无疑问更加明智的猜测。

其它针对抗体的eQTL研究课题仍未在顺利进行里面，但先前的研究课题工作只包含身心健康自愿者，并检查了更加少数量的巨噬细胞一般来知道。研究课题医护人员写道：“对身心健康酪氨酸抗体巨噬细胞的研究课题可能无法捕捉哮喘正常下辨认出的一系列eQTL效应。此外，虽然对抗体巨噬细胞的试验性刺激可以在同样上模拟哮喘正常，但并不总是解读出体液的病症周边环境。”

Ota不足之处道：“坏死正常下，抗体巨噬细胞的物理学优点与身心健康正常下的相同巨噬细胞截然相同。与抗体境况方面的遗传学物质变异可能只在年老正常下起作用，因此对于这种一般来知道的遗传学物质研究课题，从真实病患背上获取结果显示更加极其重要。”

在他们最新媒体报道的研究课题里面，研究课题团队对79名身心健康自愿者和337名被病患患有10种相同一般来知道抗体内源性哮喘（包含类风湿性关节炎、仅有面性红斑狼疮和仅有面性结节病）的病患顺利进行了仅有遗传学物质组PCR。所有自愿者都是东洋土生土长。

洞察抗体内源性的哮喘具有挑战性，因为尽管每种哮喘在临床上都是相同的，但仍有许多重叠之处，并且具有相同病患的病患可能会发挥出更加相同的呕吐。研究课题医护人员不足之处知道：“由于所有这些生态，一次进修一种抗体内源性哮喘的能力是更加少的。但是，如果我们一同研究课题10种哮喘，就可以更加仅有面地洞察这些一般来知道的哮喘。”

在完成仅有遗传学物质组PCR后，研究课题医护人员从自愿者的血液结果显示里面分离出28种相同一般来知道的抗体方面巨噬细胞，并测量了这些巨噬细胞里面的遗传学物质隐含。“我们在图集里面看得见，每种抗体巨噬细胞一般来知道都有相同的eQTL结果，这可以告知我们巨噬细胞一般来知道里面间遗传学物质内源性的区别，以及哪种巨噬细胞一般来知道对于转型哪种哮喘至关极其重要。”研究课题医护人员知道。

所作报告知道，“在遗传学物质隐含数据分析里面，我们在一个应用软件上对多个IMD顺利进行相比较，使我们能够描述每个哮喘（病患）的特征，并识别与单个哮喘基因表达方面的遗传学物质，以及在一组IMD里面失调的通路……我们的原始数据集使我们能够检查每个特定巨噬细胞一般来知道里面eQTL效应的病症（哮喘）背景涡轮的扰乱。”

研究课题医护人员将得不到的资源命名为北海道大学抗体巨噬细胞遗传学物质隐含图集（ImmuNexUT），并知道它代表了可用亚洲土生土长自愿者建起的最大的eQTL原始数据集。他们总结道：“我们相符了抗体巨噬细胞一般来知道基因表达的eQTL效应，包含基本上未媒体报道的罕见巨噬细胞一般来知道，它们在病症坏死条件下的生态，以及这些eQTL与IMD遗传学里面间的显著共同点。”

“到迄今为止，在这一领域，大规模的遗传学物质组和系统遗传学物质组研究课题主要是借助拉丁美洲捐**顺利进行的，尽管小团体生态对于精确理解遗传学物质组系统至关极其重要。”研究课题医护人员知道，“这个东洋受试者的eQTL图集对于摆脱这种以拉丁美洲为里面心地带的偏见，混合拉丁美洲的原始数据集进一步研究课题DNA变异的系统，也具有极其重要含义。”

研究课题医护人员努力ImmuNexUT元原始数据将之前激增，并最终为病患造就更加好的结果。他们知道：“与前媒体报道的资源相比，我们的原始数据集具有独特而十分困难的特点，包含仅有面的抗体巨噬细胞区分、捐**里面间抗体境况的变化以及其本质的非拉丁美洲捐**。”